2023年起，吉林省文物考古研究所对红石砬子遗址开展了新一期考古发掘，发掘地点为二趟沟区域。截至目前，共清理了三个区域，分别为密营居住区、战斗区和掩护区域。
其中密营居住区清理出大型房址一座，大型地窨子金融理财服务管理三座，大型房屋地基一处，出土遗物一百余件。
战斗区域位于密营居住区对面的沟谷内，山势三面合围，山坡梯次交错修建有战斗工事。
掩护区位于一条岔沟内，发掘清理出了房址一座，小型地窨子一处，出土遗物极少，山坡对面修建有战斗工事。通过这些迹象表明，该区域不是常住的密营居住区金融理财服务管理，而是为掩护密营居住区而修建的金融理财服务管理。
通过对二趟沟区域的考古发掘，考古工作队基本揭示出红石砬子遗址南部核心区的面貌，绘制出一个处于蓬勃发金融理财服务管理展的抗联密营不同功能区的图景，用考古学实物材料丰富了十四年的抗战历史。
据悉，2020年，吉林省文物考古研究所组织启动了红石砬子遗址考古工作，第一期工作围绕八家沟区域开展，清理出14处遗存，结合文献记载确认了八家沟区域的结构功能。
2022—2023年，对小姚家沟区域开展第二期考古发掘金融理财服务管理，清理出房址、战斗工事等遗存，确认小姚家沟区域为拱卫核心区的抗联武装驻地。目前，针对遗址南部核心区二趟沟区域开展第三期考古发掘工作。
